1、2008年中共十七屆三中全會提出“永久基本農田”的概念，“永久基本農田”即無論什么情況下都不能改變其用途，不得以任何方式挪作它用的基本農田。

2、《中華人民共和國土地管理法》（2020年1月1日起實施），該版修正案以“永久基本農田”字眼全面替代了第二次修正案中的“基本農田”。因此，“永久基本農田”是在“基本農田”概念基礎上提出來的，它既不是在原有基本農田中挑選的一定比例的優質基本農田，也不是永遠不能占用的基本農田。

基本農田前面加上“永久”二字，體現了國家對永久基本農田的高度重視，體現的是嚴格保護的態度。

1、內涵不同

耕地：根據《土地利用現狀分類》（GB/T 21010-2017）規定，耕地是指種植農作物的土地，包括熟地，新開發、復墾、整理地，休閑地（含輪歇地、休耕地）；以種植農作物（含蔬菜）為主，間有零星果樹、桑樹或其他樹木的土地；平均每年能保證收獲一季的已墾灘地和海涂。

永久基本農田：2020年起實施的新《中華人民共和國土地管理法》中，基本農田加上“永久”二字。

2、農轉用審批流程不同

建設占用永久基本農田報國務院批準；建設占用耕地超過35公頃報國務院批準。

3、非法占用刑法處罰面積不同

依據我國《刑法》和相關司法解釋，非法占用基本農田五畝以上或者非法占用基本農田以外的耕地十畝以上，造成耕地大量毀壞的，處五年以下有期徒刑或者拘役，并處或者單處罰金。

因此：耕地不一定是基本農田；基本農田保護區經依法劃定后，對基本農田實行特殊保護，任何單位作和個人不得改變或者占用。

1、根據《環境影響評價技術導則·生態影響》，（HJ19-2022）中：生態敏感區指：“包括法定生態保護區域、重要生境以及其他具有重要生態功能、對保護生物多樣性具有重要意義的區域。其中，法定生態保護區域包括：依據法律法規、政策等規范性文件劃定或確認的國家公園、自然保護區、自然公園等自然保護地、世界自然遺產、生態保護紅線等區域；重要生境包括：重要物種的天然集中分布區、棲息地，重要水生生物的產卵場、索餌場、越冬場和洄游通道，遷徙鳥類的重要繁殖地、停歇地、越冬地以及野生動物遷徙通道等。”

生態保護目標指：“受影響的重要物種、生態敏感區以及其他需要保護的物種、種群、生物群落及生態空間等。”

2、根據《建設項目環境影響評價技術導則·總綱》（HJ2.1-2016）中：“環境保護目標指環境影響評價范圍內的環境敏感區及需要特殊保護的對象。”

 “環境敏感區按條例、分類目錄執行”。

3、按照《建設項目環境影響評價分類管理名錄》所稱環境敏感區是指“依法設立的各級各類保護區域和對建設項目產生的環境影響特別敏感的區域，（二）永久基本農田。”屬于部門規章層面。

4、根據《中華人民共和國草原法》（2021年4月29日實施）中：“國家實行基本草原保護制度。”、根據《中華人民共和國森林法》（2019年12月28日實施）中：“國家對公益林實施嚴格保護。”、根據《中華人民共和國土地管理法》（2020年1月1日起實施）中：“國家實行永久基本農田保護制度”，上位法律的規定，應將基本草原、公益林、永久基本農田作為生態保護目標（雖未列入生態導則定義中，但屬于國家法律層面的規定）。

“永久基本農田的劃定和管護，必須采取行政、法律、經濟、技術等綜合手段，加強管理，以實現永久基本農田的質量、數量、生態等全方面管護。”

  具體保護要求參考《基本農田保護條例》（2011年1月8日修訂）、《內蒙古自治區實施〈中華人民共和國土地管理法〉辦法》（修訂草案，此辦法正征求意見，可參考）、《內蒙古自治區人民政府辦公廳關于進一步加強耕地保護工作的實施意見》（內政辦發〔2021〕32號）等；特別注意《內蒙古自治區基本農田保護實施細則》(1997年3月17日內蒙古自治區人民政府令第81號)已廢止。